باسیلوس thuringiensisis
باسیلوس thuringiensisis
باسیلوس thuringiensisis یک باکتری گرم مثبت است که ماده حشره کش اگزوتوکسینδ به نام پروتئین های کریستال (Cry) را تولید می کند.
سرووار tolworthi باسیلوس thuringiensisis یک سرووار معرف می باشد که برای بیش از 50 سال مطالعه شده است.
توالی ژنوم
با این حال، تنها توالی ژنوم انتخابی سرووار tolworthi نژاد Na205-3 قابل دسترس می باشد .
در اینجا، ما یک توالی ژنوم کامل از باسیلوس thuringiensisis نژاد سرووار tolworthi را از موسسه استاندارد پاستور، که در دانشگاه ساگا از 20 سال قبل معرفی شد گزارش نمودیم.
تجزیه و تحلیل DNA تصفیه شده با سیستم PacBio RS II عملکردی در حدود 103505 قرائت با میانگین طول 5.5 kb (پوشش ژنومی 70 برابری) را نشان داد.
قرائت ها با Sprai نسخه 0.9.9.2 تصحیح شده است(http://zombie.cb.ku-tokyo.ac.jp/sprai/) و مونتاژ آن با اسمبلر Celera نسخه 8.3rc1 (2)انجام گرفته است.
از آنجا که عمق پوشش قرائت PacBio (حدود 25 برابر) در منطقه در نزدیکی انتهای تکرار کروموزومی کم بود ، جمع آوری این منطقه تنها با قرائت PacBio مشکل بود .




